滇南中心城市大屯海截污排水工程是紅河州重點工程，也是公司承接的第一個項目，項目總投資近3億元。項目的實施將有效解決大屯海水質惡化、污染日趨嚴重，以及滇南中心城市大屯海周邊區域易澇、排水不暢等問題。同時，將有效地改善紅河工業園區投資環境，提高中心城市人居環境質量，是一項“功在當代，利在千秋”的民心工程。工程起點位于蒙自市雨過鋪鎮大屯海東壩與西壩交接處，終點位于個舊市雞街鎮，匯入沙甸河。該工程由排水隧洞和排水明渠兩個分項工程組成。排水隧洞全長7908米，凈斷面為3×3.5米門拱形，洞身為鋼筋混凝土全襯3.5×3米門拱形，洞身為鋼筋混凝土全襯砌結構，最大坡度為27。，最小為7。；排水明渠全長2377.52米，凈斷面為梯形，上底寬4.3米，下底寬3米，深2米，結構為M7.5漿砌石體，流量為15m3/秒。工程于2003年底開始籌建，2005年12月完成前期工作，于2006年2月全面開工建設。
該項目工程地質情況極為復雜，早在70年代，紅河州政府就想實施一個能解決蒙自周邊地區易發生洪澇災害問題的項目，并組織國外知名的地質專家進行考查和論證，專家給出的意見是“這是一項不可能實現的工程項目”。在項目施工過程中，其復雜的地質條件印證了國外專家提出的看法。根據工程地質勘察成果，隧洞穿過第三系泥灰巖和半膠結砂巖，泥灰巖和半膠結砂巖呈互層狀。泥灰巖呈土狀，大部分地段穩定性較好，局部地段節理裂隙發育，遇水易軟化，易發生坍塌和塑性變形，穩定性極差；泥灰巖具弱～中等膨脹潛勢，其膨脹性將對隧洞的支護帶來不利的影響。工程地質的突變給工程建設造成了巨大的影響，坍塌、涌水、涌砂一般事故頻發，由于塌方造成地面塌陷、帽頂、封洞等大的事故也達20多次。因此，特邀請國家級地質勘察大師徐則民到現場進行查看指導后說：“這個項目的施工地質條件史無前例，應列入科研課題作專題研究”；曾擔任云南錫業總公司總經理，具有多年礦山開采管理工作經驗的紅河州州長楊福生親臨現場調研后也感慨地說：“工程的實施難度不亞于修建青藏鐵路”。但是，在困難面前排水公司沒有退縮，而是選擇迎難而上，對建設過程中遇到的困難進行總結研究，不斷摸索積累經驗，一次次攻克了施工過程中遇到的難題。通過公司全體干部職工不懈的努力，克服重重困難，工程終于在2013年順利完工。